HD2 Video Converter Einstellungen

Hallo, habe jetzt auf meinem HD2 bissel mit der Qualität bei der Convertierung von Video Material rumgefummelt. Ich wollte euch mal meine Zusammensetztung zeigen und Meinungen austauschen.
Player ist der Core Player.
Container Format: mkv
Video Codec: H.264/AVC
Audio Codec: MP3
Auflösung 800x480 auf 25 Frames
Bitrate 1600 kpbs mit High Quality mkv Funktion
Audio Sampling 22khz/Stereo bei 192 kbps
Die Größe ist dabei etwa 45 MB auf 3 Minuten Video
Was mich bis jetzt stört ist ein, ein wenig nervöses Bild bei schnellen Bildwechseln (wie am Monitor Vsync aus) und ein gelegentliches nachladen (nimmt man kaum war aber es ist ein leichtes zucken alle 15 Sekunden)

Wie wandelt Ihr euere Sachen um? Mit welchem Proggi und welchen Einstellungen?